นักวิจัยได้เก็บตัวอย่างจากกลุ่มผู้ป่วย 212 รายที่เข้ารับการรักษาในโรงพยาบาลระหว่างเดือนเมษายนถึงพฤศจิกายน 2020 ตรวจพบ SARS-CoV-2 โดยใช้การทดสอบปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรสแบบเรียลไทม์ (RT-PCR) บนผ้าเช็ดปากช่องจมูก เพื่อยืนยันการติดเชื้อในลำไส้ ขยายขอบเขต ITS2 โดยใช้ PCR กับตัวอย่างที่ทำให้บริสุทธิ์จากผ้าเช็ดปากทางทวารหนัก การเปรียบเทียบระหว่างข้อมูลเมตาตามหมวดหมู่และตัวชี้วัดความหลากหลายอัลฟาคำนวณด้วยการทดสอบ

 สล็อต

การวิเคราะห์ขนาดผลการเลือกปฏิบัติเชิงเส้นถูกใช้เพื่อประเมินหาไบโอมาร์คเกอร์ เกณฑ์ขั้นต่ำที่ยอมรับได้คำนวณโดยการสุ่มตัวอย่างย่อยแบบวนซ้ำภายในกลุ่มเพื่อขจัดผลกระทบของขนาดตัวอย่างที่ไม่สมดุลระหว่างผู้ป่วย SARS-CoV-2 ที่เป็นบวกและลบ

ประชากรในการศึกษาขั้นสุดท้ายมีผู้เข้าร่วม 53 คน ผู้ป่วย SARS-CoV-2 30 คน โดย 21 คนไม่รุนแรง และ 23 คนที่เป็นลบ SARS-CoV-2 ผู้ป่วยรายหนึ่งได้รับยาปฏิชีวนะ และไม่มีใครได้รับการรักษาด้วยยาต้านเชื้อรา ตัวแปรอื่นๆ ที่ทราบว่าส่งผลต่อสถานะของไมโครไบโอมในลำไส้ไม่มีความแตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญระหว่างกลุ่มต่างๆ และระยะเวลาระหว่างการเข้ารับการรักษาในโรงพยาบาลและการสุ่มตัวอย่างมีความคล้ายคลึงกันในแต่ละคน

กลุ่มเชิงลบมีแนวโน้มที่จะเป็นเพศชายและอายุน้อยกว่า โรคร่วมเพียงอย่างเดียวที่แตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญระหว่างกลุ่มคือความดันโลหิตสูง ซึ่งพบได้น้อยกว่าในผู้ป่วยที่เป็นโรคโควิด-19 ที่ไม่รุนแรง ผู้ป่วยมีอาการมาตรฐานตามสัดส่วนที่คาดไว้ joker888

ผู้ป่วยที่ติดเชื้อโควิด-19 ในระดับรุนแรงหรือวิกฤตแสดงความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญในความหลากหลายของอัลฟาและเบตาในไมโครไบโอมในลำไส้ของเชื้อรา ซึ่งนำเสนอด้วยความหลากหลาย ความสมบูรณ์ และความสม่ำเสมอของแชนนอนที่ต่ำกว่าเมื่อเทียบกับผู้ป่วยโควิด-19 ที่ไม่รุนแรง

การวิเคราะห์พหุตัวแปร PERMANOVA แสดงให้เห็นความแตกต่างของไฟลัมที่มีนัยสำคัญระหว่างกลุ่ม และการวิเคราะห์พิกัดหลักเผยให้เห็นการจัดกลุ่มผู้ป่วยที่มีโรคร้ายแรงความหลากหลายในสกุลที่มีอำนาจเหนือระหว่างบุคคลในระดับสูงระหว่างผู้ป่วยแต่ละรายภายในกลุ่มที่มีลักษณะเฉพาะของไมโครไบโอมในลำไส้ของเชื้อรา โดยมีสปีชีส์เดียวที่มีอำนาจเหนือไมโครไบโอมใน 18 รายจากผู้ป่วยทั้งหมด 53 ราย โดยมีความอุดมสมบูรณ์ขั้นต่ำ 75% สิ่งนี้เกิดขึ้นบ่อยในบุคคลที่เป็นโรคร้ายแรงเมื่อเทียบกับโรคไม่รุนแรง (55% และ 19% ตามลำดับ) การวิเคราะห์การเลือกปฏิบัติเชิงเส้นของขนาดผลกระทบระบุว่าผู้ที่ทุกข์ทรมานจาก COVID-19 รุนแรงมีไฟลัม AsocmycotaและสกุลBipolarisอุดมไปด้วยไมโครไบโอมในลำไส้ ผู้ที่มีโรคร้ายแรงน้อยกว่ามีแท็กซ่าที่แตกต่างกัน 22 ชนิดเมื่อเปรียบเทียบกับกลุ่มควบคุม

ต่อจากนี้ ได้มีการวิเคราะห์ความสัมพันธ์ในระดับสกุลของไมโครไบโอมในลำไส้ของเชื้อรา เพื่อให้เข้าใจถึงเครือข่ายที่เชื้อราแข่งขันกันเพื่อแย่งชิงสารอาหารหรือผลิตสารเมตาบอลิซึม ผู้ป่วยทั้งบวกและลบมีลักษณะของชุมชนที่เชื่อมโยงถึงกันสามชุมชนที่มีการเกิดขึ้นร่วมในเชิงบวก แต่สมาชิกและปฏิสัมพันธ์ระหว่างชุมชนเหล่านี้แตกต่างกันอย่างมากระหว่างกลุ่มสกุลที่มีความสัมพันธ์เชิงบวกสูงสุด ได้แก่สกุลFusarium , Gibberella , Sarocladium , Aureobasidium , Geomyces , TrichodermaและPhialemoniopsis ผู้ป่วยที่เป็นบวก SARS-CoV-2 มีชุมชนที่เชื่อมโยงถึงกันมากที่สุด ซึ่งประกอบด้วย 32 จำพวกที่มีความสัมพันธ์ทางบวก ซึ่งรวมถึงผู้ป่วยที่เป็นบวก SARS-CoV-2 อีก 2 คน และAscomycotaอีก 30 สกุล ในผู้ป่วยที่เป็นลบ SARS-CoV-2 เครือข่ายย่อยขนาดเล็กที่มี 5 สกุลประกอบด้วยAureobasidium , Fusarium , PenicilliumและTrichoderma- ทั้งหมดนี้ผลิตเปปไทด์ต้านจุลชีพ กลุ่มนี้มีชุมชนที่สองที่เชื่อมต่อถึงกันขนาดใหญ่ขึ้นซึ่งประกอบด้วยเชื้อรา 20 สกุล โดย 13 สกุลมีความเกี่ยวข้องกับผู้ป่วยที่เป็นลบ SARS-CoV-2

มีความสัมพันธ์ระหว่างอาณาจักรที่ชัดเจนระหว่างจุลินทรีย์ในลำไส้ของเชื้อราและแบคทีเรีย นักวิจัยสามารถระบุอาร์เรย์ที่ชัดเจนของความสัมพันธ์ระหว่างอาณาจักรที่แยกความแตกต่างระหว่างผู้ป่วยทั้งสองกลุ่ม โดยทั่วไป บุคคลที่เป็นบวก SARS-CoV-2 มีความสัมพันธ์ระหว่างราชอาณาจักรในเชิงบวกน้อยลงอย่างมีนัยสำคัญ และชุมชนที่มีความสัมพันธ์เชิงบวกที่ใหญ่ที่สุดในผู้ป่วยเชิงลบก็ไม่ปรากฏ และก็ไม่ใช่ชุมชนอื่นที่เด่นชัดน้อยกว่า

สองสกุลที่ทราบว่ามีคุณสมบัติต้านการอักเสบและหมดไปในผู้ป่วย SARS-CoV-2 ได้แก่BifidobacteriumและRoseburiaมีความสัมพันธ์เชิงลบกับกลุ่มเชื้อราในกลุ่มผู้ป่วยที่เป็นลบ และไม่เกี่ยวข้องกับความสัมพันธ์ระหว่างอาณาจักรในผู้ป่วยที่เป็นบวก SARS-CoV-2 .